长春市儿童医院病理科成立于1964年，病理科共有医、技人员5人。现在拥有全封闭自动脱水机等先进的仪器设备，为临床病理诊断的顺利开展提供重要支撑。

病理科实行科主任负责制，在学科带头人王彦主任领导下，开展常规活体组织病理诊断、尸体解剖、术中快速冰冻病理诊断、免疫病理诊断、电镜病理诊断、腔镜小活检病理诊断、多种组织化学染色等项目。

病理科自成立以来，一直注重医疗、科研及人才培养等工作，年活体组织病理诊断量达千余例，在儿童病理诊断方面能够形成自己的特色和优势。